GUMed ze wsparciem ABM na Interdyscyplinarne Pomorskie Centrum Medycyny Cyfrowej

Podczas konferencji zorganizowanej 11 października br. prezes Agencji Badań Medycznych dr hab. Radosław Sierpiński przekazał symboliczny czek na ponad 24 mln 115 tys. zł konsorcjantom, których reprezentowali: prof. dr hab. Marcin Gruchała – rektor Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, prof. dr hab. inż. Bogusław Łazarz – prorektor ds. ogólnych Politechniki Śląskiej, dr hab. Marcin Marciniak, prof. UG – prodziekan ds. nauki Wydziału Matematyki, Fizyki i Informatyki Uniwersytetu Gdańskiego oraz Jakub Kraszewski, dyrektor naczelny Uniwersyteckiego Centrum Klinicznego w Gdańsku.

Danych pacjentów wykorzystane na potrzeby do analiz naukowych

– Interdyscyplinarne Pomorskie Centrum Medycyny Cyfrowej to projekt, który wymaga od nas współpracy. Sam Gdańskim Uniwersytet Medyczny razem ze szpitalem klinicznym nie byłby w stanie go zrealizować – podkreślił rektor GUMed prof. Marcin Gruchała. – Dotyczy pozyskania w sposób bezpieczny z zasobów szpitalnych danych pacjentów do analiz informatycznych i naukowych. Są to informacje, które mogą służyć zarówno postępowi medycyny i badaniom naukowym, jak też lepszemu zarządzaniu szpitalem i uniwersytetem.

Dzięki alokowanym środkom w wysokości pół miliarda złotych 18 jednostek z całej Polski utworzy infrastrukturę umożliwiającą dostęp do dużej liczby wiarygodnych danych, przy jednoczesnym zachowaniu kontroli nad źródłami, które je generują. Jak zaznaczył prezes ABM dr hab. Radosław Sierpiński, Regionalne Centra Medycyny Cyfrowej to centra przyszłości.

– Centrum Medycyny Cyfrowej to wielka szansa dla pacjentów i naukowców na to, żeby tworzyć naukę na najwyższych poziomie. Liczymy na to, że interdyscyplinarność projektu okaże się kluczem do sukcesu. To dofinansowanie to kolejny krok w rozwoju Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego i kolejna cegiełka, którą tutaj dokładamy – mówił dr hab. Radosław Sierpiński, prezes Agencji Badań Medycznych. – Myślę, że w ciągu najbliższych kilku lat będziemy musieli się zmierzyć z tematem danych. Z uwagi na to, że są to informacje wrażliwe, muszą podlegać największym rygorom. Agencja, która ma w sobie także komponentę rządową, będzie czuwała, żeby były one maksymalnie bezpieczne i wykorzystywane w tych najwłaściwszych celach.

Utworzenie Regionalnych Centrów Medycyny Cyfrowej przyczyni się do rozwoju rozwiązań IT

Przełoży się to na poprawę skuteczności leczenia pacjentów i ich dostępu do innowacyjnych terapii, co w efekcie pozwoli zaspokoić potrzeby zdrowotne społeczeństwa i zlikwidować bariery obecnie występujące w systemie opieki medycznej. Prace nad stworzeniem systemów informatycznych powinny zakończyć się w ciągu 1,5 roku.

– Medycyna to obszar, w którym będziemy w najbliższych latach obserwować najszybszy przyrost liczby różnych danych. To wspaniała pożywka dla sztucznej inteligencji i zaawansowanych algorytmów uczenia maszynowego – dodał prof. dr hab. inż. Bogusław Łazarz, prorektor ds. ogólnych Politechniki Śląskiej. – Naszym zadaniem będzie to, aby te dane jak najlepiej spożytkować, opracowując odpowiednie oprogramowanie w celu jak najlepszego leczenia pacjentów i odkrywania nowych możliwości, których jeszcze nie zauważono. Uczenie maszynowe sztuczne i sztuczna inteligencja stwarza takie możliwości, które w wielu zakresach potrafią przekroczyć możliwości człowieka. Tak widzimy swoją rolę w tym projekcie.

Powstanie Centrum pozwoli na zdecydowany i trwały wzrost potencjału naukowego GUMed i partnerów projektowych. Zostanie on zrealizowany poprzez m.in. umożliwienie przesyłania zanonimizowanych i zaszyfrowanych danych klinicznych ze szpitalnego systemu HIS do bezpiecznego systemu analitycznego, dostępnego dla uprawnionych badaczy.

– Dla Uniwersytetu Gdańskiego to będzie początek wspólnej przygody z Gdańskim Uniwersytetem Medycznym. Do projektu chcemy wnieść wiedzę i doświadczenie naszych informatyków, którzy specjalizują się w sztucznej inteligencji i w uczeniu maszynowym – przekazał dr hab. Marcin Marciniak, prof. UG, prodziekan ds. nauki Wydziału Matematyki, Fizyki i Informatyki Uniwersytetu Gdańskiego. – Chcemy popracować nad ulepszeniem czy stworzeniem jakichś nowych algorytmów do analizy obrazu. Być może uda nam się stworzyć algorytmy usprawniające przepływ pacjentów. Tych planów mamy kilka i cieszymy się, że nasi informatycy będą mogli zaangażować się w bardzo ważny projekt, który w ostatecznym rozrachunku ma służyć ludziom.

Interdyscyplinarne Pomorskie Centrum Medycyny Cyfrowej

Utworzenie na terenie Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego Interdyscyplinarnego Pomorskiego Centrum Medycyny Cyfrowej (IP_CMC) jest szansą na usprawnienie i zintensyfikowanie prowadzenia badań naukowych w obszarze medycyny poprzez zastosowanie rozwiązań informatycznych, umożliwiających dostępność danych w postaci elektronicznej oraz narzędzi do ich automatycznej analizy, agregowania, przetwarzania do postaci użytecznej dla konkretnego projektu badawczego. Pozwoli to nie tylko na pozyskiwanie cennej informacji, na podstawie której badacz jest w stanie udowadniać tezy naukowe, ale również budowanie algorytmów sztucznej inteligencji w wyniku zastosowania zaawansowanych technik uczenia maszynowego.

Prototyp systemu pod nazwą Szyna Danych został pilotażowo wykorzystany do odpowiedzi na zapytania o dane kliniczne dla ponad 400 pacjentów w ramach 3 projektów badawczych. Zostanie on rozbudowany do formy bezpiecznej, centralnej hurtowni danych.

Poprzez realizację projektu zostanie rozbudowana infrastruktura Centralnego Biobanku GUMed, co poprawi efektywność zbierania i udostępniania próbek materiału biologicznego. Uzupełnione zostaną również zasoby Centrum Analiz Biostatystycznych i Bioinformatycznych GUMed, które powstało w ramach realizacji projektu Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza oraz Multidyscyplinarnego Centrum Wsparcia Badań Klinicznych GUMed-UCK-UCS.

Hurtownia danych

Wielkość wolumenu danych wymaga zapewnienia dużych zasobów pamięciowych oraz wydajnego systemu informatycznego, który będzie udostępniał dane w sposób zautomatyzowany i w krótkim czasie. Odpowiedzią na to zapotrzebowanie jest hurtownia danych, która będzie kluczowym elementem technologicznym w Interdyscyplinarnym Pomorskim Centrum Medycyny Cyfrowej. Rozwiązanie informatyczne oparte na hurtowni danych będzie uzupełnione narzędziami informatycznymi służącymi do eksploracji, analizy i przetwarzania danych na potrzeby projektów badawczych oraz rozwiązaniem automatyzującym logistykę związaną z dostępem do danych.

Ponadto zostaną opracowane procedury, standardy i rozwiązania informatyczne zapewniające bezpieczeństwo przetwarzanych danych i informacji oraz ciągłość działania systemu, obejmujące szeroko rozumiany IT Governance i Data Governance.

Głównym celem projektu jest stworzenie infrastruktury (hurtownia danych ustrukturyzowanych, obrazowych, sekwencyjnych, tekstowych; infrastruktura teleinformatyczna), narzędzi (systemy informatyczne) i organizacji (kadra, struktura organizacyjna, procesy, procedury, standardy, zaplecze lokalowe) wpierającej realizację badań naukowych w obszarze medycyny cyfrowej w GUMed i we współpracy z innymi jednostkami badawczymi.

PRZECZYTAJ TAKŻE: W gdańskim UCK powstanie Centrum Medycyny Pediatrycznej