Dzięki badaniu ścieków zidentyfikowano 1334 nowe gatunki bakterii

Dr hab. Ravi Kant z Zakładu Parazytologii Tropikalnej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego jest współautorem publikacji pt. „Time-series sewage metagenomics distinguishes seasonal, human-derived and environmental microbial communities potentially allowing source-attributed surveillance”. Artykuł nt. metagenomiki ścieków w szeregach czasowych rozróżniających sezonowe, antropogeniczne i środowiskowe społeczności mikrobiologiczne ukazał się pod koniec sierpnia na łamach „Nature Communications”.

Pod kierownictwem dr. Patricka Munka z Technical University of Denmark naukowcy analizowali próbki ścieków z pięciu europejskich miast, w wyniku czego zidentyfikowano 1334 nowe gatunki bakterii. Dzięki analizom szeregów czasowych badanie ujawniło wzorce zastępowania taksonów bakteryjnych, trendy sezonowe i taksony związane z człowiekiem.

Zidentyfikowano 1334 nowe gatunki bakterii

Dr hab. Ravi Kant z Zakładu Parazytologii Tropikalnej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego był odpowiedzialny w tym projekcie za rozwój potoku bioinformatycznego, zaprojektowanego specjalnie do analizy danych sekwencjonowania nowej generacji (NGS), ze szczególnym uwzględnieniem metagenomiki wirusów i bakterii. Ten innowacyjny potok odegrał kluczową rolę w analizie złożonych danych dotyczących ścieków podłużnych, przyczyniając się do pomyślnych wyników badania.

Oprócz swojego wkładu w badania dr hab. Kant dołączył niedawno do rad redakcyjnych kilku prestiżowych czasopism, w tym Viruses (MDPI), Frontiers in Microbiology i Frontiers in Tuberculosis. Jego doświadczenie i wiedza w dziedzinie bioinformatyki i metagenomiki wciąż wywiera znaczący wpływ zarówno na bliższą społeczność akademicką, jak i na szerszy świat naukowy. Zainteresowania naukowe dr. hab. Kanta obejmują poszukiwanie nowych i powracających patogenów oraz badania nad zmiennością i ewolucją wirusów. Jego prace były już publikowane w czasopismach takich jak Nature (pt. „Ancestral allele of DNA polymerase gamma modifies antiviral tolerance”) oraz Plos Pathogenes (pt. „The assembly of neutrophil inflammasomes during COVID-19 is mediated by type I interferons”).

Źródło: Gdański Uniwersytet Medyczny

PRZECZYTAJ TAKŻE: Oporne na antybiotyki bakterie mogą żyć w organizmie latami